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60-12-8/《合成生物學(xué)》期刊 | 姜岷,信豐學(xué)等:2-苯乙醇生物合成的研究進(jìn)展手機(jī)掃碼訪問本站
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2-苯乙醇(2-PE)是一種具有玫瑰花香味的脂肪醇,因其具有溫和的、淡雅的玫瑰花般的氣味,被認(rèn)為是食品和化妝品工業(yè)中的重要香料成分。此外,它還可被用作合成其他香料或藥物化合物的底物,如苯乙酸、苯乙醛和乙酸苯乙酯等。在自然界中,2-PE主要從玫瑰、茉莉花、番茄和蕎麥等花卉和植物組織的精油中提取。然而,由于這些植物中的2-PE濃度非常低,因此萃取過程非常復(fù)雜,并且花卉的收獲也會(huì)受到天氣、植物病害和貿(mào)易限制等因素的影響。從玫瑰或其他植物的精油中提取天然2-PE的成本非常高,如提取天然2-PE的原料玫瑰精油國(guó)際市場(chǎng)的價(jià)格就已高達(dá)3500~6000美元/kg。所有這些因素都是導(dǎo)致天然2-PE的供應(yīng)不足和成本過高的主要原因。
目前,全球市場(chǎng)上2-PE的年產(chǎn)量已經(jīng)超過10 000 t,其主要生產(chǎn)方法是苯-環(huán)氧乙烷合成法和氧化苯乙烯加氫法,國(guó)際市場(chǎng)上苯-環(huán)氧乙烷合成法產(chǎn)品占40%,氧化苯乙烯加氫法產(chǎn)品占60%。苯-環(huán)氧乙烷合成法生產(chǎn)的產(chǎn)品所含微量雜質(zhì)不同,香氣差異較大,大多不能用于香料,國(guó)內(nèi)主要采用氧化苯乙烯加氫法?;瘜W(xué)合成過程一般在高溫、高壓、強(qiáng)酸或強(qiáng)堿環(huán)境等惡劣條件下操作,會(huì)產(chǎn)生許多不良副產(chǎn)物,如乙苯、苯乙烯等,這不僅增加了下游成本,而且嚴(yán)重降低了2-PE的級(jí)別。對(duì)環(huán)保工藝日益增長(zhǎng)的需求以及消費(fèi)者對(duì)“天然”產(chǎn)品的偏好極大地刺激了香料和香料生物生產(chǎn)工藝的發(fā)展。許多具有2-PE生產(chǎn)能力的野生型菌株已經(jīng)被分離并鑒定,其中大多數(shù)是真核生物,包括釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、馬克斯克魯維酵母(Kluyveromyces marxianus)、解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica)、米曲霉(Aspergillus oryzae)、黑曲霉(Aspergillus niger)、季也蒙畢赤酵母(Meyerozyma guilliermondii)等。然而,除了葉微桿菌(Microbacterium foliorum)、變形桿菌(Proteus vulgaris)和嗜冷桿菌(Psychrobactersp.)外,很少有原核生物可以合成2-PE。生物轉(zhuǎn)化過程通常在溫和的條件下進(jìn)行,產(chǎn)物選擇性高。此外,根據(jù)美國(guó)食品和藥物管理局以及相關(guān)的歐洲法規(guī)規(guī)定,如果用于生產(chǎn)過程的底物是天然的,則生物生產(chǎn)的2-PE會(huì)被認(rèn)為是“天然的”。目前,利用生物轉(zhuǎn)化法生產(chǎn)2-PE已取得重大突破。其中,合成生物學(xué)著力于構(gòu)建“非自然存在下的生化系統(tǒng)”,通過利用不同的生物元件,構(gòu)建全新的菌株代謝網(wǎng)絡(luò),從而高效合成人類需求的代謝產(chǎn)物。通過使用有效的代謝工程策略可以調(diào)節(jié)不同酶的基因表達(dá)水平,以找到最佳平衡,進(jìn)而改善代謝通量并減少代謝負(fù)擔(dān)或其他副作用,從而將廉價(jià)的葡萄糖或苯丙氨酸轉(zhuǎn)化為高附加值的2-PE。本文作者全面綜述2-PE合成的各種途徑、調(diào)控機(jī)制以及提高2-PE產(chǎn)量的策略。同時(shí),討論了農(nóng)工廢棄物作為2-PE生產(chǎn)原料的利用和原位產(chǎn)物分離(ISPR)技術(shù)的應(yīng)用。
目前,2-PE的生物合成主要有3種途徑(圖1)。其中,艾氏途徑是最重要的途徑,在氮限條件下,L-苯丙氨酸(L-Phe)通過三步酶催化反應(yīng)轉(zhuǎn)化為2-PE。第2個(gè)途徑是莽草酸途徑,它是以葡萄糖等碳水化合物為底物從頭合成2-PE。然而,這種復(fù)雜的反應(yīng)途徑具有強(qiáng)烈的反饋抑制作用,導(dǎo)致2-PE生產(chǎn)效率低下。最后一種是苯乙胺途徑,它與艾氏途徑類似,在植物中起著更重要的作用。
圖1 2-苯乙醇的生物合成途徑
EMP—糖酵解途徑;HMP—磷酸戊糖途徑;AT—轉(zhuǎn)氨酶;PDC—苯丙酮酸脫羧酶;ADH—醇脫氫酶;AAAD—芳香族氨基酸脫羧酶;MAO—單胺氧化酶;PAAS—苯乙醛合酶
艾氏途徑廣泛存在于各種微生物中,它負(fù)責(zé)將支鏈氨基酸(亮氨酸、纈氨酸和異亮氨酸)、芳香族氨基酸(苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸)和含硫氨基酸(蛋氨酸)分解代謝成相應(yīng)的雜酸或高級(jí)醇。該途徑最初是由艾氏(Ehrlich)描述的,因此用其名字進(jìn)行命名。如圖1所示,在該途徑中,L-Phe首先被轉(zhuǎn)氨酶(ARO8,ARO9,BAT1/TWT1和BAT2/TWT2)氨基化為苯丙酮酸,然后被苯丙酮酸脫羧酶(YDR380w/ARO10,YDL080C/THI3,PDC1,PDC5和PDC6)脫羧為苯乙醛,最后通過醇脫氫酶(ADH1,ADH2,ADH3,ADH4和ADH5)或甲醛脫氫酶(SFA1)還原為2-PE。
在艾氏途徑中關(guān)鍵酶的表達(dá)水平會(huì)受到相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控和氮調(diào)控策略的調(diào)節(jié)。其中,Zn2CyS6家族轉(zhuǎn)錄激活因子ARO80是2-PE合成中最重要的調(diào)控因子之一。研究結(jié)果表明,ARO80可以與aro9和aro10的啟動(dòng)子組成性結(jié)合,在芳香族氨基酸的存在下,ARO80可以激活aro9與aro10的表達(dá)。在芳香族氨基酸作為唯一氮源的條件下,芳香族氨基酸通過氨基酸通透酶Gap1進(jìn)入細(xì)胞,Aro80接受芳香族氨基酸的誘導(dǎo)信號(hào)后與aro9和aro10基因啟動(dòng)子上的CCG重復(fù)序列結(jié)合,激活艾氏途徑關(guān)鍵酶基因的表達(dá)。除ARO80以外,與碳代謝有關(guān)的鋅簇蛋白CAT8同樣是艾氏途徑中一個(gè)重要的激活因子,它在調(diào)節(jié)受芳香醇影響的基因(如Adh2)的差異表達(dá)中起著重要作用。同時(shí),CAT8的表達(dá)還會(huì)受到具有兩個(gè)Cys2His2鋅指結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)錄因子MIG1的調(diào)控,CAT8的過表達(dá)或MIG1的缺失可以有效增加aro9和aro10的轉(zhuǎn)錄,從而使更多的苯丙氨酸轉(zhuǎn)化為苯乙醛。
此外,艾氏途徑中關(guān)鍵酶的表達(dá)水平也會(huì)受到氮源種類的影響。當(dāng)培養(yǎng)基中存在優(yōu)選氮源(銨或天冬酰胺)時(shí),氮分解代謝物阻抑(NCR)的全局氮調(diào)控會(huì)嚴(yán)重限制酵母使用非優(yōu)選氮源(亮氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸和脯氨酸)的能力。從分子生物學(xué)的角度來看,目前已經(jīng)鑒定出4個(gè)可以影響NCR敏感基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯水平的GATA因子,其中包括兩個(gè)激活因子(Gln3和Gat1/Nil1)以及兩個(gè)阻遏因子(Dal80/Uga43和Gzf3/Nil2/Deh1)。當(dāng)優(yōu)選氮源存在時(shí),Gln3和Gat1被隔離在細(xì)胞質(zhì)中,無法參與靶基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控。當(dāng)無優(yōu)選氮源存在時(shí),Gln3和Gat1就會(huì)轉(zhuǎn)移到細(xì)胞核中,從而激活NCR敏感基因的表達(dá)[圖2(a)]。另外,Gln3還會(huì)受到pr病毒樣URE2蛋白的負(fù)調(diào)控,攜帶失活URE2的細(xì)胞即使在優(yōu)選氮源存在時(shí)也能夠利用非優(yōu)選氮源。此外,雷帕霉素也可以影響到氮調(diào)控,經(jīng)過雷帕霉素處理可以模擬氮饑餓環(huán)境,從而導(dǎo)致Gln3和Gat1的核定位和NCR敏感基因的激活。研究表明,影響艾氏途徑中關(guān)鍵酶表達(dá)水平的轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)和NCR調(diào)節(jié)呈現(xiàn)復(fù)雜的互補(bǔ)調(diào)節(jié)和部分自身調(diào)節(jié),ARO80是ARO80靶啟動(dòng)子招募GATA因子所必需的,而GATA因子也可通過氨基酸通透性的轉(zhuǎn)錄調(diào)控間接影響ARO80的活性,兩者之間相互協(xié)作共同調(diào)控艾氏途徑中關(guān)鍵酶的表達(dá)。此外,芳香醇的合成還會(huì)受到細(xì)胞密度的正反饋調(diào)節(jié)。一般來說,由于芳香醇是群體感應(yīng)分子,可以使酵母在氮饑餓的情況下轉(zhuǎn)變?yōu)榻z狀體,因此高密度的細(xì)胞每個(gè)細(xì)胞可以產(chǎn)生更多的芳香醇。轉(zhuǎn)錄組分析顯示,在高細(xì)胞密度時(shí),aro9和aro10的轉(zhuǎn)錄水平顯著增強(qiáng)。圖2(b)顯示了通過艾氏途徑合成2-PE的總體調(diào)控圖,但其調(diào)控機(jī)制尚不清楚。
圖2 苯乙醇生物合成的代謝網(wǎng)絡(luò)調(diào)控
(Gap1/Wap1/Agp1/Bap2/Bap3/Tat2—氨基酸通透酶;ARO9/ARO8/Bat1/Twt1/Bat2/TwT2—轉(zhuǎn)氨酶;ARO10/PDC1/PDC5/PDC6/THI3—苯丙酮酸脫羧酶;Adh1/2/3/4/5—醇脫氫酶;Sfa1—醛脫氫酶)
莽草酸/苯丙酮酸途徑是酵母等微生物中從頭合成2-PE的途徑。該途徑將碳水化合物代謝與芳香族化合物合成聯(lián)系起來,其中包括3種芳香族氨基酸(苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸)和其他芳香族次級(jí)代謝物。首先葡萄糖經(jīng)過糖酵解途徑和磷酸戊糖途徑被轉(zhuǎn)化為磷酸烯醇式丙酮酸和4-磷酸赤蘚糖,這兩種物質(zhì)再經(jīng)過4步酶促反應(yīng)轉(zhuǎn)化為莽草酸,接著莽草酸經(jīng)過代謝轉(zhuǎn)化為苯丙酮酸。苯丙酮酸隨后如艾氏途徑所述(圖1)通過脫羧和脫氫被轉(zhuǎn)化為2-PE。米曲霉、馬克思克魯維酵母和釀酒酵母等均表現(xiàn)出具有利用葡萄糖合成2-PE的能力,但是由于其生物合成途徑復(fù)雜,代謝支路多且存在多種反饋抑制因子,2-PE的產(chǎn)量很低。在最佳生長(zhǎng)條件下,芳香族氨基酸的胞內(nèi)濃度足以使苯丙氨酸和酪氨酸敏感的同工酶基本上失活。因此,尋找能夠增加L-Phe或苯丙酮酸池的優(yōu)質(zhì)菌株是提高利用莽草酸途徑合成2-PE效率的關(guān)鍵。
苯乙胺途徑是與艾氏途徑相類似的途徑,該途徑首先是在釀酒酵母和米曲霉中得到研究。在該途徑中,L-Phe首先被脫羧成苯乙胺,然后被氧化脫氨成苯乙酸,最后被還原成2-PE(圖1)。苯乙胺途徑在諸如番茄等植物中起著非常重要的作用。并且,在矮牽?;ê兔倒寤ò曛幸呀?jīng)發(fā)現(xiàn)了該途徑的替代方法,其中L-Phe可以通過苯乙醛合酶(PAAS)一步轉(zhuǎn)化為L(zhǎng)-苯乙醛。所有這些天然途徑的研究與發(fā)現(xiàn)為構(gòu)建基因工程菌株提供了有效酶的良好來源。
培養(yǎng)基成分和培養(yǎng)條件對(duì)2-苯乙醇的合成影響很大。為提高2-苯乙醇生產(chǎn)的經(jīng)濟(jì)性,研究人員對(duì)菌種誘變選育、基因編輯、培養(yǎng)基組成優(yōu)化、發(fā)酵條件優(yōu)化等常規(guī)策略進(jìn)行了廣泛研究,并取得了很大進(jìn)展。
2-苯乙醇可由許多微生物進(jìn)行合成。然而,由于其產(chǎn)量仍然太低,現(xiàn)在并不適合于工業(yè)化生產(chǎn)。但是對(duì)于艾氏途徑和莽草酸途徑的研究為利用基因編輯等技術(shù)提高2-PE的產(chǎn)量提供了廣闊的前景。例如:通過過量表達(dá)ARO8和ARO10,S. cerevisiaeS288在培養(yǎng)60 h后可以合成2.61 g/L 2-PE,比原始菌株高出36.8%。為了加快L-Phe在釀酒酵母中的轉(zhuǎn)運(yùn)速度,Chen等通過過量表達(dá)MT2和S. cerevisiaeYS58來源的Gap1基因來提高芳香族氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)體的表達(dá)水平,2-PE產(chǎn)量分別增加了26.5%和25.3%。此外,ARO80、GLN3、GAT1和CAT8等全局調(diào)控因子的引入,使2-PE產(chǎn)量分別顯著增加58%、34.7%、30.6%和62%。最近,在最佳發(fā)酵條件下,一個(gè)由L-Phe轉(zhuǎn)運(yùn)體Gap1、轉(zhuǎn)氨酶ARO8、苯丙酮酸脫羧酶ARO10、醇脫氫酶ADH2和谷氨酸脫氫酶GDH2組裝而成的人工構(gòu)建菌株S. cerevisiaeYS58(G1-A8-A10-A2)-GDH在5 L發(fā)酵罐中的2-PE合成產(chǎn)量達(dá)到6.3 g/L(轉(zhuǎn)化率為95%),顯示出2-PE產(chǎn)業(yè)化的良好前景。
除艾氏途徑外,利用莽草酸途徑從頭合成2-PE同樣具有重要意義。Aoki和Uchida獲得了一株經(jīng)過化學(xué)誘變處理的突變株Z. rouxiiNISL3355,使2-PE產(chǎn)量提高了約38倍。類似地,Kim等獲得了一株馬克思克魯維酵母的抗苯丙氨酸類似物(對(duì)氟苯丙氨酸)抗性突變體,該突變體在不添加L-Phe的情況下從20 g/L葡萄糖中可以產(chǎn)生1.3 g/L 2-PE。相比于傳統(tǒng)的誘變選育等方法,通過基因工程改造對(duì)于2-PE的合成則更加有效。最近,Daran等在釀酒酵母中過量表達(dá)ARO4、ARO7、3ABP、TKL1、ARO10、PYK1D146N、EcaroL、ARO3K222L,并敲除aro3和aro8,最終使得2-PE的產(chǎn)量達(dá)到1.59 g/L。類似地,Xu等通過過量表達(dá)ylPAR4、ylARO10、ylARO7、ylPHA2、scARO7G141S,并敲除ylPYK,使得Y. lipolyticaYL35以葡萄糖為底物可以合成2.42 g/L 2-PE,為目前利用莽草酸途徑合成2-PE的最高產(chǎn)量。
雖然酵母具有天然的2-PE合成途徑,但發(fā)酵過程通常很長(zhǎng)(2~4 d),這增加了設(shè)備成本和能源消耗,進(jìn)一步限制了工業(yè)化的可擴(kuò)展性。因此,除了酵母以外,大腸桿菌也取得了重大突破。由于艾氏途徑不完整,野生的大腸桿菌無法合成2-PE,通過引入玫瑰來源的PAAS基因,經(jīng)過發(fā)酵48 h該克隆菌株可以產(chǎn)0.34 g/L 2-PE。Guo等在大腸桿菌MG1655中共表達(dá)aro8、KDC和yigB使2-PE的產(chǎn)量增加到0.28 g/L。同樣的,Atsumi等通過在大腸桿菌BW25113中共表達(dá)kivD和ADH2也獲得了類似的結(jié)果,2-PE產(chǎn)量最終可以達(dá)到0.88 g/L。在艾氏途徑中,提高還原力NAD(P)H是合成2-PE的一個(gè)重要因素。在全細(xì)胞轉(zhuǎn)化系統(tǒng)中,Hwang等將來源于枯草芽孢桿菌的葡萄糖脫氫酶引入大腸桿菌,通過氧化葡萄糖來促進(jìn)NAD(P)H的再生,從而使2-PE的產(chǎn)量提高了3倍。在另一項(xiàng)研究中,將來源于枯草芽孢桿菌的谷氨酸脫氫酶在大腸桿菌BW25113(31G)中過表達(dá),以加速還原力的再生,最終工程菌株的2-PE產(chǎn)量提高了250%。為了改善輔因子與還原力不足的問題,Wang等開發(fā)了一種輔因子自給自足的系統(tǒng),將谷氨酸脫氫酶與轉(zhuǎn)氨酶和乙醇脫氫酶偶聯(lián),可同時(shí)再生共底物(2-酮酸)和氧化還原力[NAD(P)H],最終使生物催化效率提高了3.8倍。和酵母一樣,大腸桿菌同樣擁有莽草酸途徑,通過引入一條從L-Phe到2-PE的路線,可以使其利用葡萄糖從頭合成2-PE。Guo等通過過量表達(dá)aroGfbr、pheAfbr、kdc、yjgB和aro8等基因,最終獲得可以利用葡萄糖合成1016 mg/L 2-PE的工程菌株DG02。Koma等在大腸桿菌中進(jìn)一步引入了T7啟動(dòng)子來增強(qiáng)Azospirillum brasilense來源的苯丙酮酸脫羧酶基因(ipdC)和Lactobacillus brevis來源的乙醇脫氫酶基因(adhC)的表達(dá),同時(shí)敲除內(nèi)源的苯乙醛脫氫酶基因(feaB)。該工程菌株最終利用葡萄糖合成7.7 mmol/L(0.94 g/L)2-PE。Kang等優(yōu)化了莽草酸途徑中4種關(guān)鍵酶aroFfbr、pheAfbr、kdc和adh1的協(xié)同表達(dá),重組大腸桿菌可以利用葡萄糖合成285 mg/L 2-PE。
生物轉(zhuǎn)化在2-PE生產(chǎn)中顯示出廣闊的前景。然而,和其他醇類物質(zhì)一樣,高濃度的2-PE對(duì)微生物細(xì)胞有一定的毒性,當(dāng)發(fā)酵液中的2-PE濃度達(dá)到一定程度時(shí),就會(huì)抑制微生物的生長(zhǎng),而且2-PE和乙醇聯(lián)合作用產(chǎn)生的毒性比它們各自產(chǎn)生的毒性作用累加要高。2-PE的抑菌作用機(jī)理很復(fù)雜,但通常認(rèn)為主要是由其物化特性引起,而不是對(duì)特定受體的抑制。抑制作用的主要部位可能是原生質(zhì)膜,影響糖類和氨基酸運(yùn)輸系統(tǒng),此外,由于膜的通透性增加,加速了離子和小分子代謝產(chǎn)物跨膜向胞外擴(kuò)散,擾亂了跨膜質(zhì)子電勢(shì)。因此,該特性導(dǎo)致的生產(chǎn)力受限仍然是一個(gè)顯著的瓶頸,這促使研究人員去尋求性能更優(yōu)的菌株。商業(yè)上用于從葡萄糖生產(chǎn)甘油的菌株Candida glycerinogenesWL2002-5表現(xiàn)出4 g/L的高2-PE耐受性。利用該菌株通過分批發(fā)酵可以產(chǎn)生5 g/L 2-PE,是目前使用野生型菌株合成2-PE的最高產(chǎn)量。另外,2-PE的生產(chǎn)已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了與隨機(jī)突變相結(jié)合的巨大進(jìn)展。例如,經(jīng)過紫外線輻射處理后,S. cerevisiaeCWY13210的突變菌株與原始菌株相比,2-PE耐受性和產(chǎn)量分別提高了50%和9.1%。同樣,通過紫外線照射獲得的S. cerevisiaeBD-25-39突變體可以合成5.4 g/L 2-PE,比原始菌株提高10.2%。值得注意的是,由于2-PE具有親脂性,仍然難以完全消除其所引起的毒性。因此,仍然需要更有效的誘變和篩選方法。此外,引入一些耐受性因子,例如與膜相關(guān)的熱休克蛋白HSP12,可以保護(hù)脂質(zhì)體膜的完整性,避免其受到不利環(huán)境的影響。
在工業(yè)發(fā)酵過程中,發(fā)酵培養(yǎng)基的成分對(duì)于代謝產(chǎn)物的效價(jià)和產(chǎn)率至關(guān)重要。如上所述,氮源的利用遵循特定的順序。因此,L-Phe總是作為唯一氮源來激活艾氏途徑。但是,少量的有機(jī)氮源,如酵母提取物則有利于細(xì)胞生長(zhǎng)而不抑制艾氏途徑。有趣的是,Barbosa等發(fā)現(xiàn),通過添加少量無機(jī)氮源,如磷酸二銨(DAP),可顯著減少乙醇和乙酸的形成,并增加2-PE的產(chǎn)量。這可能是由于氮源的加入促進(jìn)了NADH的再生,但其機(jī)制仍有待進(jìn)一步闡明。碳源的主要功能是維持菌株生長(zhǎng)并提供必要的輔因子,如2-酮酸和NADH。一般情況下,隨著碳源的增加,2-PE的產(chǎn)量也會(huì)增加,但這種提高是有限的。此外,不同的碳源可以改變L-Phe的消耗百分比、2-PE和2-苯乙基衍生物的摩爾產(chǎn)率。通過與果糖、蔗糖、麥芽糖和糖蜜進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)葡萄糖是S. cerevisiaeCWY132合成2-PE的最適碳源。但是為了降低成本,廉價(jià)的碳源(如粗甘油和其他工業(yè)廢料)則具有更好的價(jià)值。此外,維生素和礦物質(zhì)對(duì)生產(chǎn)2-PE也有很大影響。例如,與初始條件相比,K. marxianusCBS 600在發(fā)酵條件優(yōu)化后需要的維生素劑量是初始條件的80倍,這表明在生物轉(zhuǎn)化條件下優(yōu)化后的代謝壓力更大。在惡劣條件下,Ca2+和Mg2+都可以通過增加膜穩(wěn)定性來保護(hù)細(xì)胞。當(dāng)MgSO4添加量增加到0.4 g/L時(shí),2-PE產(chǎn)量提高了1.65倍。當(dāng)KH2PO4增加到6 g/L時(shí),2-PE的產(chǎn)量也出現(xiàn)了類似的增加。
一般來說,香料的合成過程對(duì)培養(yǎng)溫度非常敏感。高溫可以增強(qiáng)一些與酒精產(chǎn)生有關(guān)的酶的表達(dá),如BAT1/2。然而,超過最佳溫度范圍,醇類的生成量將顯著降低。以釀酒酵母為例,當(dāng)培養(yǎng)溫度從30 ℃增加到40 ℃時(shí),2-PE產(chǎn)量下降到1/3~1/23。在20~35 ℃的培養(yǎng)溫度下,L-Phe的消耗量在80.5%~90.1%之間變化;當(dāng)溫度升高到40 ℃時(shí),L-Phe的消耗量顯著降低21.9%。除了溫度之外,pH也會(huì)通過影響酶活性從而影響芳香物質(zhì)的產(chǎn)量和成分。艾氏途徑中的關(guān)鍵酶如ARO8和ARO9是堿性上調(diào)的,而ARO10則是相反的堿性下調(diào);因此,需要采用折中的pH來平衡整個(gè)艾氏途徑。此外,pH也會(huì)改變基質(zhì)的離子狀態(tài),影響吸附劑對(duì)2-PE的吸附容量。在以氨基酸為唯一氮源且葡萄糖受限的有氧條件下,氨基酸主要轉(zhuǎn)化為雜酸。然而,在厭氧條件下,氨基酸幾乎完全轉(zhuǎn)化為雜醇。雜酸(和雜醇)的分布與培養(yǎng)條件密切相關(guān)。基于此,Tian等在發(fā)酵培養(yǎng)基中加入了一些抗壞血酸以提高系統(tǒng)的還原水平,抑制副產(chǎn)物的產(chǎn)生。在這一改良系統(tǒng)中生產(chǎn)的2-PE與標(biāo)準(zhǔn)2-PE樣品表現(xiàn)出最接近的香氣相似性。
除培養(yǎng)條件外,發(fā)酵方式對(duì)2-PE產(chǎn)量也有影響。據(jù)文獻(xiàn)記載,2-PE的合成過程與細(xì)胞生長(zhǎng)密切相關(guān),當(dāng)葡萄糖濃度超過一定水平時(shí),在有氧條件下會(huì)產(chǎn)生大量乙醇。乙醇的積累對(duì)2-PE的產(chǎn)生有很大的協(xié)同抑制作用。為了防止發(fā)酵過程中產(chǎn)生比1 g/L高的乙醇,Rong等利用活性干酵母生產(chǎn)2-PE。在該體系中,酵母降解乙醇以提供還原力NADH,最終可以利用8 g/L的L-Phe合成7.6 g/L的2-PE。
鑒于培養(yǎng)基組成和培養(yǎng)條件對(duì)2-PE生產(chǎn)的影響,需要進(jìn)行更合理的優(yōu)化研究。近年來,統(tǒng)計(jì)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)如單因素優(yōu)化、遺傳算法、Box-Behnken中心組合設(shè)計(jì)、響應(yīng)面法等已被廣泛使用(表1)。Etschmann等利用遺傳算法優(yōu)化了13種培養(yǎng)基成分和培養(yǎng)溫度,最終,利用K. marxianusCBS 600將2-PE的產(chǎn)量提高了87%。Mei等采用單因素、正交設(shè)計(jì)、Box-Behnken中心組合設(shè)計(jì)和響應(yīng)面法對(duì)培養(yǎng)基成分進(jìn)行優(yōu)化,利用S. cerevisiaeBD將2-PE的產(chǎn)量由1.19 g/L提高到4.18 g/L。統(tǒng)計(jì)方法的采用不僅減少了工作量,而且評(píng)估了多個(gè)參數(shù)之間的相互作用,特別是在利用復(fù)雜的農(nóng)產(chǎn)工業(yè)廢物方面。例如,當(dāng)Plackett-Burman設(shè)計(jì)、steepest ascent設(shè)計(jì)和Box-Behnken設(shè)計(jì)結(jié)合起來優(yōu)化可發(fā)酵培養(yǎng)物的培養(yǎng)基成分、酸堿度和發(fā)酵時(shí)間時(shí),2-PE產(chǎn)量提高了3.3倍。
表1 基于統(tǒng)計(jì)設(shè)計(jì)的2-PE發(fā)酵工藝優(yōu)化
農(nóng)業(yè)和工業(yè)廢物被認(rèn)為是復(fù)雜碳水化合物、蛋白質(zhì)、脂類和各種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的儲(chǔ)存庫(kù)。將這些廢物生物轉(zhuǎn)化為增值產(chǎn)品,如2-PE,不僅可以防止廢物處置造成的環(huán)境污染,還可以增加經(jīng)濟(jì)價(jià)值。例如,葡萄含有復(fù)雜的成分,包括糖、有機(jī)酸、酚類化合物、蛋白質(zhì)、維生素等,當(dāng)使用它作為碳源并供應(yīng)5 g/L L-Phe時(shí),利用K. marxianusCBS 6556可以合成0.77 g/L 2-PE。糖蜜是一種眾所周知的工業(yè)廢料,富含混合糖和微量元素。當(dāng)使用甜菜糖蜜作為碳源并添加7 g/L L-Phe時(shí),利用K. marxianusCBS 600 可以合成0.89 g/L 2-PE。在使用K. marxianusATCC 10022進(jìn)行固態(tài)發(fā)酵時(shí),以L-Phe及干燥的固體甘蔗渣為原料可合成2-PE 10.2 mg/g 。當(dāng)在甘蔗糖蜜廢水中添加6 g/L L-Phe時(shí),使用微生物混合培養(yǎng)物可獲得0.99 g/L 2-PE。另外,季也蒙畢赤酵母、發(fā)酵單胞菌和釀酒酵母等都可以利用乳清培養(yǎng)基通過分批發(fā)酵的方式合成1.17~3.28 g/L 2-PE。煙草廢料是一種眾所周知的可再生資源,因?yàn)樗胸S富的芳香族化合物,是合成香料的潛在前體。在不添加任何L-Phe的情況下使用釀酒酵母可以從39.28 g/L煙草廢料和10 g/L葡萄糖中產(chǎn)生1.55 g/L 2-PE。此外,木薯廢水、番茄、辣椒渣等也都含有豐富的碳水化合物和營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),為2-PE的生產(chǎn)提供了可替代的底物。然而,應(yīng)該指出的是,由于這些農(nóng)用工業(yè)廢物中成分復(fù)雜且未知,2-PE的產(chǎn)量仍然很低且不穩(wěn)定。
香料生產(chǎn)的瓶頸之一是由于其疏水特性會(huì)使得脂質(zhì)膜結(jié)構(gòu)成為優(yōu)先結(jié)合的目標(biāo),導(dǎo)致跨膜梯度的崩潰,從而喪失細(xì)胞活力。不同的微生物對(duì)于香料的細(xì)胞毒性表現(xiàn)出不同的耐受水平。例如,2.0 g/L外源2-PE可以完全抑制馬克思克魯維酵母的生長(zhǎng);而釀酒酵母則可以耐受高達(dá)4 g/L的2-PE。為了減輕細(xì)胞毒性增加2-PE的產(chǎn)量,有機(jī)溶劑萃取、疏水吸附、有機(jī)滲透汽化、環(huán)糊精(CDs)絡(luò)合和超臨界CO2萃取等ISPR技術(shù)已被廣泛用于去除發(fā)酵液中的2-PE。表2列舉了已發(fā)表文獻(xiàn)中關(guān)于原位產(chǎn)物分離(ISPR)技術(shù)在2-PE生產(chǎn)中的應(yīng)用。
表2 用于2-PE生產(chǎn)的不同的原位產(chǎn)物分離(ISPR)技術(shù)
液-液萃取法(LLE)采用有機(jī)溶劑從有機(jī)相中連續(xù)提取疏水產(chǎn)物,因其簡(jiǎn)單、廉價(jià)、易擴(kuò)展等特點(diǎn)而被廣泛應(yīng)用于香精生產(chǎn)。例如,當(dāng)使用油酸作為萃取劑時(shí),使用釀酒酵母可以獲得12.6 g/L 2-PE,與沒有使用提取技術(shù)相比,2-PE的含量增加了8.6 g/L。用油醇作為萃取劑,使K. marxianusCBS 600的2-PE產(chǎn)量提高了3倍。此外,聚丙二醇1500和1200 (PPG 1500和PPG 1200)等高分子萃取劑在2-PE分離中同樣表現(xiàn)出良好的萃取性能。在以PPG 1500為萃取劑的補(bǔ)料分批發(fā)酵中,萃取劑中的2-PE濃度超過22 g/L,總濃度達(dá)到7.5 g/L。當(dāng)以PPG 1200為萃取劑時(shí),有機(jī)相中2-PE含量為26.5 g/L,2-PE Ac含量為6.1 g/L,2-PE總質(zhì)量濃度達(dá)到10.5 g/L。
在液-液萃取中,發(fā)酵液被泵入抽提裝置以連續(xù)回收2-PE[圖3(a)]。2-PE生產(chǎn)可以得到顯著改善,但仍存在一些缺陷。首先,有機(jī)溶劑會(huì)對(duì)細(xì)胞活力和代謝活性造成嚴(yán)重的毒性。因此,理想的萃取劑應(yīng)具有良好的生物相容性和較高的分配系數(shù)。其次,乳狀液的形成將影響液體和溶劑相的分離。最后,也是最重要的一點(diǎn),液-液分離系統(tǒng)中使用的有機(jī)溶劑,特別是高碳含量的有機(jī)溶劑,很難蒸發(fā)從而去除2-PE,殘留的溶劑會(huì)嚴(yán)重影響2-PE的質(zhì)量。因此,尋找合適的有機(jī)溶劑是液-液分離操作的關(guān)鍵??紤]到2-PE的脂溶性,使用一些脂肪酸/油脂作為萃取劑可作為一種2-PE回收的方法。菜籽油首先被證實(shí)可以將2-PE的整體濃度提高2.7倍。此外,疏水中空纖維膜可以被用來阻擋催化介質(zhì)中的有機(jī)溶劑,從而避免乳狀液的形成。但需要注意的是,該膜易受污染。
近年來,不相容離子液體(ILS)因其可忽略的蒸氣壓、不可燃性和高熱穩(wěn)定性而成為綠色非有機(jī)溶劑受到越來越多的關(guān)注。通過對(duì)9種離子液體的生物相容性、分配系數(shù)(Kd)和萃取效率的綜合考察,發(fā)現(xiàn)3種基于[NTf2]?的離子液體具有很大的提高2-PE產(chǎn)量的潛力。使用基于[NTf2]?的ILS,觀察到2-PE的總產(chǎn)量增加了3.5倍。此外,[NTf2]?、[TCM]?和[TCB]?基離子液體可以有效地從水相中回收2-PE。
圖3 應(yīng)用于2-PE生產(chǎn)中的ISPR技術(shù)
為了進(jìn)一步提高萃取效率,研究了一種液-固萃取系統(tǒng)(LSE)。在這個(gè)系統(tǒng)中,有機(jī)溶劑被包裹到聚合物基質(zhì)中,這不僅解決了微生物毒性和乳狀液的問題,而且還簡(jiǎn)化了下游的加工過程[圖3(b)]。將癸二酸二丁酯包埋在聚乙烯的聚合物基質(zhì)中后,不僅沒有形成乳狀液,2-PE的產(chǎn)率還提高了1倍。通過將癸二酸二丁酯嵌入到海藻酸鹽微膠囊中,設(shè)計(jì)了一條將LSE體系與膜工藝相結(jié)合的新工藝。在該體系中,不會(huì)形成乳狀液,使用S. cerevisiaeGIV2009,最終2-PE濃度提高到5.6 g/L,比使用單相時(shí)提高了1.8 g/L。雖然LSE的性能優(yōu)于LLE,但溶劑固定化會(huì)增加成本,使生產(chǎn)過程復(fù)雜化。
原位產(chǎn)物吸附(ISPA)是一種常見的ISPR技術(shù),它使用樹脂或其他吸附介質(zhì)來避免底物或產(chǎn)物的抑制[圖3(c)]。ISPA因其操作相對(duì)簡(jiǎn)單、易放大、對(duì)有毒物質(zhì)不敏感、易于再生和成本低而被廣泛應(yīng)用于生物技術(shù)過程。為了回收2-PE,人們研究了各種樹脂。非極性大孔樹脂D101對(duì)2-PE的吸附能力較強(qiáng),對(duì)L-Phe的吸附能力較低。在添加2 g/L水合樹脂D101的條件下,S. cerevisiaeBD可獲得6.17 g/L 2-PE產(chǎn)量。當(dāng)使用7%(干重)的交聯(lián)聚苯乙烯樹脂HZ818時(shí),用S. cerevisiaeP-3從12 g/L L-Phe中得到6.6 g/L 2-PE,摩爾產(chǎn)率為0.744,比對(duì)照提高了66.2%。當(dāng)大孔樹脂F(xiàn)D 0816作為連續(xù)生物轉(zhuǎn)化系統(tǒng)的吸附劑時(shí),摩爾產(chǎn)率最高,為0.90。然而,樹脂對(duì)2-PE的吸附容量很低,而且吸附過程受發(fā)酵液的影響很大。該文對(duì)幾種聚合物吸附劑進(jìn)行了測(cè)試,以確定具有較高選擇性的吸附劑。例如:將Hytrel?8206應(yīng)用于固-液兩相分離生物反應(yīng)器系統(tǒng),在3 L的發(fā)酵體積內(nèi)可獲得13.7 g/L 2-PE。當(dāng)采用半連續(xù)反應(yīng)器結(jié)構(gòu)時(shí),2-PE的最高濃度為20.4 g/L,水相為1.4 g/L,聚合物相為97 g/L。
5.4.1 有機(jī)滲透汽化
滲透汽化是一種膜分離過程,在膜分離過程中,一層致密的無孔膜將液體溶液從氣相中分離出來。在裝有聚辛基甲基硅氧烷(POMS)膜的有機(jī)滲透汽化裝置中,分批培養(yǎng)獲得了2.2 g/L和1.3 g/L的雙倍2-PE濃度。然而,這些膜很容易被污染,仍然需要探索更合適的膜材料。
5.4.2 與環(huán)糊精(CDs)絡(luò)合
CDs是具有疏水內(nèi)部和親水外部的超分子主體化合物。眾所周知,CDs及其衍生物與許多有機(jī)化合物形成包合物。在最佳條件下,β-CD對(duì)2-PE的萃取率為1 mol/mol。
5.4.3 超臨界CO2萃取
超臨界流體(SCFs)具有高吸附能力、高擴(kuò)散系數(shù)和低黏度等特點(diǎn),被廣泛應(yīng)用于從土壤、水和沉淀物中提取有機(jī)污染物。無毒和不可燃的二氧化碳(CO2)是目前工業(yè)中使用的最流行和最便宜的超臨界流體材料。特別是超臨界CO2在玫瑰混凝土揮發(fā)油的提取過程中表現(xiàn)出優(yōu)異的性能。然而,直接利用超臨界CO2萃取是不可能的,因?yàn)镃O2對(duì)細(xì)胞活力有很大的影響。因此,在提取之前進(jìn)行細(xì)胞分離是必要的。
由于植物提取的局限性和化學(xué)合成工藝的缺陷,生物合成2-PE受到越來越多的關(guān)注。雖然在機(jī)理認(rèn)識(shí)和提高2-PE效價(jià)方面取得了很大突破,但在經(jīng)濟(jì)上仍不具備工業(yè)化的可行性。為了將實(shí)驗(yàn)室研究成果轉(zhuǎn)化為工業(yè)過程,底盤菌種開發(fā)、生物過程優(yōu)化和ISPR技術(shù)設(shè)計(jì)之間的深度集成綜合開發(fā)是必要的。
在自然界中,許多真菌可以自主合成2-PE,但產(chǎn)量仍然很低。代謝工程對(duì)于改善2-PE的生產(chǎn)至關(guān)重要,它可以減輕反饋抑制,增強(qiáng)前體轉(zhuǎn)運(yùn),提高關(guān)鍵酶活性,并干擾副產(chǎn)物的形成。通過對(duì)2-PE合成途徑的改造或引入耐受因子,選擇耐受性好、產(chǎn)2-PE能力強(qiáng)的菌株可能是獲得較好的2-PE生產(chǎn)候選菌株的唯一途徑。此外,目前對(duì)2-PE合成的調(diào)控機(jī)制還沒有進(jìn)行深入的研究。更好地理解艾氏途徑/莽草酸途徑涉及的生物化學(xué),特別是酶及其代謝調(diào)節(jié),是指導(dǎo)進(jìn)一步遺傳修飾的基礎(chǔ)。
培養(yǎng)基組成和培養(yǎng)條件對(duì)2-PE的生產(chǎn)有很大影響。從經(jīng)濟(jì)的角度來看,高增值產(chǎn)品的生產(chǎn)率和產(chǎn)品質(zhì)量遠(yuǎn)比實(shí)際產(chǎn)量重要。然而,培養(yǎng)基成分的改變無疑會(huì)增加生物催化法合成2-PE的生產(chǎn)成本,不利于該技術(shù)的工業(yè)化應(yīng)用。因此,進(jìn)一步研究利用農(nóng)業(yè)或工業(yè)副產(chǎn)品為主要原料,如制糖工業(yè)的副產(chǎn)品糖蜜,可以節(jié)約生產(chǎn)成本,有利于該工藝的工業(yè)化應(yīng)用。目前報(bào)道的不利用原位產(chǎn)物分離技術(shù)的2-PE最高生產(chǎn)率只有0.12 g/(L·h),為了更好地實(shí)現(xiàn)2-PE商業(yè)化生產(chǎn),更多的研究應(yīng)該集中在2-PE的生產(chǎn)率上。
ISPR技術(shù)已廣泛應(yīng)用于2-PE生產(chǎn)中,尤其是LLE和ISPA。然而,LLE系統(tǒng)中殘留有機(jī)溶劑的去除困難限制了其應(yīng)用。與LLE相比,ISPA具有更大的工業(yè)放大潛力。在實(shí)際生產(chǎn)中,ISPR技術(shù)必定會(huì)增加生產(chǎn)過程的復(fù)雜性和成本,因此,仍需進(jìn)一步研究開發(fā)更多的高容量吸附材料運(yùn)用于完整細(xì)胞的原位產(chǎn)物分離技術(shù),如合成聚合物。隨著生物技術(shù)和跨學(xué)科的快速發(fā)展,采用更先進(jìn)的發(fā)酵方式,如將不同的生物材料應(yīng)用到微生物發(fā)酵過程中,設(shè)計(jì)使用可以同時(shí)合成并分離2-PE的新型反應(yīng)器等,同時(shí)結(jié)合ISPR技術(shù),使用優(yōu)質(zhì)菌株,將進(jìn)一步提高2-PE的生產(chǎn)效率。此外,對(duì)“天然”香料日益增長(zhǎng)的需求將使得利用生物法合成2-PE的商業(yè)前景更加廣闊。