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棉子糖是主要存在于棉子和甜菜中一種非還原性三糖，在所有三糖中與人類的關(guān)系較大，因為棉子餅可被用作飼料或油料，甜菜主要用于制造蔗糖，都是常見的農(nóng)作物。α-半乳糖激酶(α-GAL)可以將棉子糖水解為蔗糖與半乳糖，這在工業(yè)生產(chǎn)中可被用來提高甜菜的產(chǎn)蔗糖量。人體消化道沒有這種酶，因而無法水解利用棉子糖。棉子糖進入人體結(jié)腸后，被產(chǎn)氣菌酵解利用，產(chǎn)生腸氣。這也是吃豆類（富含棉子糖）會有腸氣的原因。
棉子糖為白色或淡黃色晶狀粉末。一般結(jié)晶體帶有5分子的結(jié)晶水，緩慢加熱100℃會喪失結(jié)晶水。水溶液的比旋光度[α]D為+105°。帶結(jié)晶水的產(chǎn)品熔點為80℃。
棉子糖易溶于水，微溶于乙醇等極性溶劑，不溶于石油醚等非極性溶劑。20℃時水中溶解度為14%，且隨溫度升高溶解度顯著增大，80℃時，高于蔗糖的溶解度。
棉子糖可由棉籽餅?zāi)シ鬯饣蛱鸩颂敲壑频谩?/p>
棉子糖作為一種低聚糖，可服用以調(diào)節(jié)腸道菌群。