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苯酚 - 氯仿 - 異戊醇混合物又叫酚-氯仿-異戊醇混合物,是指由上述三種試劑組成的混合物。
高效提取土壤微生物DNA的方法,包括如下步驟:
(1)稱取0.3-0.4g樣品加入Lysing Matrix E Tube中。加入978μl的SPB,加入122μ l的MT Buffer;
(2)蓋緊Lysing Matrix E Tube的蓋子,將離心管置于渦旋混合儀上,對管內(nèi)物質(zhì)進行震蕩破碎均質(zhì)化,時間設(shè)定為40-50s。在8000r/min轉(zhuǎn)速下離心15min。
(3)將上清液用大槍頭吸出轉(zhuǎn)入2ml的微離心管中,加入等體積的酚-氯仿-異戊醇 (25:24:1),顛倒混勻,15℃,10000rpm,離心10min;
(4)轉(zhuǎn)移上清至干凈的離心管中,加入等體積的氯仿-異戊醇(24:1),顛倒混勻,15 ℃,10000rpm,離心10min,取上清;
(5)加入250μl的PPS,顛倒混勻10次以上,室溫靜置10min;
(6)在8000r/min轉(zhuǎn)離心5min,用大口槍頭將上清液轉(zhuǎn)移至2ml離心管;
(7)吸取800μl的搖勻Binding Matrix加入上一步中的離心管;
(8)將離心管上下顛倒2min后靜置3min,等待二氧化硅基質(zhì)沉淀;
(9)移除500μl上清液,避免吸出沉淀物;
(10)將剩余的上清液與沉淀物重新混勻,吸取約600μl混合液移入SPIN Filter 中,8000r/min轉(zhuǎn)下離心1min;
(11)倒掉收集管中的液體,重復上一步操作直至2ml離心管中的液體吸盡;
(12)加入已制備好的SEWS-M溶液500μl,用小槍頭小心混勻后,8000r/min轉(zhuǎn)下離 心1min,棄去收集管中的液體;
(13)重復上一步后,將收集管更換為1.5ml的Catch Tube;
(14)在室溫下,將SPIN Filter風干5-10min;
(15)往SPIN Filter中加入80μl的DES溶液,用小槍頭使之與Binding Matrix混 勻,65℃水浴15min。8000r/min轉(zhuǎn)下離心2min,可得到約50μl的DNA溶液,再加入80μl的DES 溶液重復這一步操作,即可獲得約100μl的土壤微生物DNA溶液。
[1] [中國發(fā)明] CN201711361715.X 一種高效提取土壤微生物DNA的方法